Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 FAM153C-201ENST00000398106 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 LINC00967-203ENST00000518035 1502 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 RNF212-201ENST00000333673 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 TRPM3-205ENST00000361823 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 LINC02026-202ENST00000414309 772 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 KRT8P30-201ENST00000432100 650 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 HNRNPA3P12-201ENST00000437410 1063 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 CCND3P1-201ENST00000438347 580 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 EIF5A2-205ENST00000487522 565 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 AP004550.1-201ENST00000532652 514 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 BLOC1S1-202ENST00000548556 525 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 AC009163.5-202ENST00000571737 466 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 MIR4254-201ENST00000581063 76 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 HIST1H3B-201ENST00000621411 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 COLQ-202ENST00000383786 1482 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 HNRNPC-205ENST00000553300 1375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 ERG-211ENST00000453032 1595 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 PINX1-201ENST00000314787 1545 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 COASY-202ENST00000421097 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 NNMT-203ENST00000535401 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 AIG1-203ENST00000367596 559 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 KRTAP2-3-201ENST00000391418 875 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 ATP5J-202ENST00000400087 826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 AC104212.2-201ENST00000478813 628 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 ZNF175-204ENST00000596504 580 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 HIST1H3E-201ENST00000614911 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 GH1-203ENST00000351388 685 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 MIR632-201ENST00000385193 94 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 AL137244.1-201ENST00000422931 865 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 RIC3-205ENST00000425599 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 TXNL4B-203ENST00000426362 965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 TMEM222-203ENST00000464813 1071 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 ARHGEF26-AS1-203ENST00000480639 582 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 GLUD1P3-201ENST00000507952 896 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 AC004923.3-201ENST00000527532 355 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 C11orf1-202ENST00000528125 534 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 CCND3P2-201ENST00000579393 537 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 AC011489.1-201ENST00000586744 690 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 CTSH-218ENST00000615999 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 DANT2-201ENST00000430756 2079 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 DDX19B-213ENST00000568625 1681 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 PSMC5-212ENST00000581882 1474 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 REG3G-202ENST00000393897 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 CFL1P6-201ENST00000400899 494 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 AL121987.1-201ENST00000435580 645 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 C11orf58-207ENST00000525684 575 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 C11orf58-209ENST00000528634 776 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 SAA2-206ENST00000530400 323 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 ZNF677-210ENST00000601413 706 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 AC092073.1-202ENST00000606020 653 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 AC245369.7-201ENST00000631386 350 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 DDC-212ENST00000615193 1674 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 ZNF485-202ENST00000374435 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms