Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FHOD3Q2V2M9 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FHOD3Q2V2M9 HTD2-205ENST00000477305 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FHOD3Q2V2M9 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FHOD3Q2V2M9 PAX5-204ENST00000377852 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FHOD3Q2V2M9 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FHOD3Q2V2M9 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
FHOD3Q2V2M9 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FHOD3Q2V2M9 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FHOD3Q2V2M9 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FHOD3Q2V2M9 MPV17-209ENST00000405983 859 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FHOD3Q2V2M9 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FHOD3Q2V2M9 AC112250.1-201ENST00000504640 745 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
FHOD3Q2V2M9 SMAD1-AS1-201ENST00000513542 481 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FHOD3Q2V2M9 IFI27L1-211ENST00000557066 580 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FHOD3Q2V2M9 KRT8P34-201ENST00000577607 1044 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
FHOD3Q2V2M9 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FHOD3Q2V2M9 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FHOD3Q2V2M9 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FHOD3Q2V2M9 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FHOD3Q2V2M9 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FHOD3Q2V2M9 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FHOD3Q2V2M9 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FHOD3Q2V2M9 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FHOD3Q2V2M9 AC064850.1-201ENST00000413279 1398 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
FHOD3Q2V2M9 SLC7A8-214ENST00000621729 1371 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FHOD3Q2V2M9 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FHOD3Q2V2M9 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FHOD3Q2V2M9 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FHOD3Q2V2M9 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FHOD3Q2V2M9 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FHOD3Q2V2M9 RCC2P5-201ENST00000492126 1487 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
FHOD3Q2V2M9 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
FHOD3Q2V2M9 KRTAP10-9-201ENST00000397911 1171 ntAPPRIS P2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FHOD3Q2V2M9 AL157823.1-201ENST00000403727 628 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
FHOD3Q2V2M9 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FHOD3Q2V2M9 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FHOD3Q2V2M9 TONSL-AS1-201ENST00000442850 428 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FHOD3Q2V2M9 PILRA-205ENST00000453419 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FHOD3Q2V2M9 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
FHOD3Q2V2M9 AC120498.7-201ENST00000562876 330 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
FHOD3Q2V2M9 AL031705.1-201ENST00000566922 682 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FHOD3Q2V2M9 SCAMP5-216ENST00000568081 710 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FHOD3Q2V2M9 LINC01996-201ENST00000573270 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FHOD3Q2V2M9 AC087741.1-204ENST00000573935 646 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FHOD3Q2V2M9 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FHOD3Q2V2M9 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
FHOD3Q2V2M9 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FHOD3Q2V2M9 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FHOD3Q2V2M9 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
FHOD3Q2V2M9 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FHOD3Q2V2M9 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FHOD3Q2V2M9 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FHOD3Q2V2M9 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FHOD3Q2V2M9 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FHOD3Q2V2M9 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FHOD3Q2V2M9 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FHOD3Q2V2M9 AC008536.3-201ENST00000623282 1599 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
FHOD3Q2V2M9 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FHOD3Q2V2M9 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FHOD3Q2V2M9 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FHOD3Q2V2M9 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FHOD3Q2V2M9 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FHOD3Q2V2M9 SNORA57-201ENST00000383870 149 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
FHOD3Q2V2M9 ELFN1-AS1-201ENST00000415399 636 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FHOD3Q2V2M9 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FHOD3Q2V2M9 KCCAT198-201ENST00000549251 549 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FHOD3Q2V2M9 AC018845.3-201ENST00000562536 516 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FHOD3Q2V2M9 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
FHOD3Q2V2M9 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
FHOD3Q2V2M9 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FHOD3Q2V2M9 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FHOD3Q2V2M9 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FHOD3Q2V2M9 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FHOD3Q2V2M9 KRT8P42-201ENST00000405771 1399 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
FHOD3Q2V2M9 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FHOD3Q2V2M9 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FHOD3Q2V2M9 KRT37-201ENST00000225550 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FHOD3Q2V2M9 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
FHOD3Q2V2M9 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FHOD3Q2V2M9 FAHD2B-201ENST00000272610 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FHOD3Q2V2M9 FAM9B-201ENST00000327220 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FHOD3Q2V2M9 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FHOD3Q2V2M9 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
FHOD3Q2V2M9 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FHOD3Q2V2M9 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FHOD3Q2V2M9 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
FHOD3Q2V2M9 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FHOD3Q2V2M9 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FHOD3Q2V2M9 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FHOD3Q2V2M9 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FHOD3Q2V2M9 CHEK2-203ENST00000382565 696 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FHOD3Q2V2M9 CPSF4L-202ENST00000397671 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FHOD3Q2V2M9 PHBP10-201ENST00000416467 784 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
FHOD3Q2V2M9 AC005077.3-201ENST00000449614 213 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
FHOD3Q2V2M9 HNRNPA3P6-201ENST00000472163 1006 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
FHOD3Q2V2M9 LINC00824-204ENST00000520766 597 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FHOD3Q2V2M9 IGHEP1-201ENST00000521393 651 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
FHOD3Q2V2M9 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FHOD3Q2V2M9 AC091304.3-201ENST00000566500 716 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms