Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SKOR1P84550 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SKOR1P84550 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKOR1P84550 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKOR1P84550 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKOR1P84550 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SKOR1P84550 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SKOR1P84550 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SKOR1P84550 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SKOR1P84550 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SKOR1P84550 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SKOR1P84550 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SKOR1P84550 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SKOR1P84550 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SKOR1P84550 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SKOR1P84550 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SKOR1P84550 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SKOR1P84550 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SKOR1P84550 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SKOR1P84550 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SKOR1P84550 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SKOR1P84550 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SKOR1P84550 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SKOR1P84550 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SKOR1P84550 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SKOR1P84550 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SKOR1P84550 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SKOR1P84550 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SKOR1P84550 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SKOR1P84550 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SKOR1P84550 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SKOR1P84550 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SKOR1P84550 AC124312.2-201ENST00000546615 427 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SKOR1P84550 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SKOR1P84550 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SKOR1P84550 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SKOR1P84550 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SKOR1P84550 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SKOR1P84550 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SKOR1P84550 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SKOR1P84550 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SKOR1P84550 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SKOR1P84550 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SKOR1P84550 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SKOR1P84550 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SKOR1P84550 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SKOR1P84550 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SKOR1P84550 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SKOR1P84550 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SKOR1P84550 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SKOR1P84550 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SKOR1P84550 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SKOR1P84550 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SKOR1P84550 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SKOR1P84550 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SKOR1P84550 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SKOR1P84550 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SKOR1P84550 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SKOR1P84550 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SKOR1P84550 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SKOR1P84550 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SKOR1P84550 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SKOR1P84550 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SKOR1P84550 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SKOR1P84550 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SKOR1P84550 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SKOR1P84550 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SKOR1P84550 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SKOR1P84550 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SKOR1P84550 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SKOR1P84550 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SKOR1P84550 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SKOR1P84550 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SKOR1P84550 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SKOR1P84550 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SKOR1P84550 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SKOR1P84550 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SKOR1P84550 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SKOR1P84550 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SKOR1P84550 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SKOR1P84550 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SKOR1P84550 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SKOR1P84550 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SKOR1P84550 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SKOR1P84550 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SKOR1P84550 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SKOR1P84550 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SKOR1P84550 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SKOR1P84550 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SKOR1P84550 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SKOR1P84550 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SKOR1P84550 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SKOR1P84550 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SKOR1P84550 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SKOR1P84550 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SKOR1P84550 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SKOR1P84550 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SKOR1P84550 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SKOR1P84550 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SKOR1P84550 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms