Protein–RNA interactions for Protein: P62891

RPL39, 60S ribosomal protein L39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P62891 MTMR2-201ENST00000346299 4681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPL39P62891 MTMR2-203ENST00000393223 4681 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPL39P62891 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPL39P62891 PIK3AP1-201ENST00000339364 4803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPL39P62891 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPL39P62891 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPL39P62891 MFSD8-241ENST00000641686 4991 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPL39P62891 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPL39P62891 DLGAP3-201ENST00000235180 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPL39P62891 AGPAT3-202ENST00000327505 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPL39P62891 AGPAT3-204ENST00000398061 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPL39P62891 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPL39P62891 CDH8-201ENST00000299345 3728 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPL39P62891 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPL39P62891 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
RPL39P62891 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPL39P62891 ENOX1-201ENST00000261488 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPL39P62891 TLL2-201ENST00000357947 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPL39P62891 MUC20-203ENST00000436408 2463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPL39P62891 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPL39P62891 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPL39P62891 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPL39P62891 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPL39P62891 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPL39P62891 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPL39P62891 RERE-212ENST00000476556 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPL39P62891 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPL39P62891 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPL39P62891 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPL39P62891 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
RPL39P62891 ABI2-202ENST00000261017 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPL39P62891 AC073957.3-201ENST00000609998 6758 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
RPL39P62891 PITX2-211ENST00000613094 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPL39P62891 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPL39P62891 ATG5-202ENST00000360666 2712 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPL39P62891 ARHGEF33-201ENST00000398800 4300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPL39P62891 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPL39P62891 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPL39P62891 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPL39P62891 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPL39P62891 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPL39P62891 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPL39P62891 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPL39P62891 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPL39P62891 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPL39P62891 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPL39P62891 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
RPL39P62891 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPL39P62891 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPL39P62891 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPL39P62891 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
RPL39P62891 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPL39P62891 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPL39P62891 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPL39P62891 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPL39P62891 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPL39P62891 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPL39P62891 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPL39P62891 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPL39P62891 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPL39P62891 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
RPL39P62891 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPL39P62891 GLIS3-202ENST00000381971 3961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPL39P62891 RASA4CP-203ENST00000446874 3193 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPL39P62891 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPL39P62891 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPL39P62891 TNC-212ENST00000542877 5517 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPL39P62891 BCL2L2-201ENST00000250405 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPL39P62891 DPP8-204ENST00000358939 2822 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPL39P62891 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPL39P62891 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPL39P62891 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPL39P62891 TTYH3-204ENST00000407643 4537 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPL39P62891 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPL39P62891 LSM14A-201ENST00000433627 3424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPL39P62891 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPL39P62891 FBLN2-207ENST00000492059 4193 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPL39P62891 BDNF-208ENST00000418212 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPL39P62891 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPL39P62891 OXR1-202ENST00000312046 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPL39P62891 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPL39P62891 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPL39P62891 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPL39P62891 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPL39P62891 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RPL39P62891 SMARCA4-205ENST00000450717 5506 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPL39P62891 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPL39P62891 MYCBP-201ENST00000397572 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPL39P62891 PGM3-201ENST00000283977 2219 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPL39P62891 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
RPL39P62891 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPL39P62891 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPL39P62891 GRAMD1B-216ENST00000638157 3849 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPL39P62891 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPL39P62891 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPL39P62891 TGM2-201ENST00000361475 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPL39P62891 HTR2C-201ENST00000276198 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPL39P62891 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPL39P62891 SLC5A8-201ENST00000536262 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RPL39P62891 XRCC6-201ENST00000359308 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms