Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
USP46P62068 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USP46P62068 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC15.04■□□□□ -0
USP46P62068 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USP46P62068 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USP46P62068 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
USP46P62068 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
USP46P62068 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USP46P62068 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USP46P62068 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.04■□□□□ -0
USP46P62068 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC15.04■□□□□ -0
USP46P62068 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
USP46P62068 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USP46P62068 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC15.04■□□□□ -0
USP46P62068 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
USP46P62068 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.04■□□□□ -0
USP46P62068 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
USP46P62068 AC106732.1-201ENST00000512458 550 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
USP46P62068 HTR4-207ENST00000520514 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USP46P62068 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC15.04■□□□□ -0
USP46P62068 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
USP46P62068 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
USP46P62068 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
USP46P62068 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
USP46P62068 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
USP46P62068 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USP46P62068 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC15.04■□□□□ -0
USP46P62068 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
USP46P62068 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC15.04■□□□□ -0
USP46P62068 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC15.04■□□□□ -0
USP46P62068 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USP46P62068 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
USP46P62068 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USP46P62068 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USP46P62068 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
USP46P62068 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USP46P62068 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USP46P62068 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
USP46P62068 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
USP46P62068 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USP46P62068 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
USP46P62068 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USP46P62068 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
USP46P62068 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
USP46P62068 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
USP46P62068 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
USP46P62068 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
USP46P62068 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USP46P62068 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USP46P62068 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USP46P62068 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
USP46P62068 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
USP46P62068 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USP46P62068 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC15.03■□□□□ -0
USP46P62068 AL157938.2-207ENST00000415391 884 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
USP46P62068 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
USP46P62068 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC15.03■□□□□ -0
USP46P62068 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USP46P62068 LINC01014-203ENST00000455307 548 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
USP46P62068 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
USP46P62068 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
USP46P62068 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC15.03■□□□□ -0
USP46P62068 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
USP46P62068 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC15.03■□□□□ -0
USP46P62068 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
USP46P62068 METTL23-207ENST00000588783 1184 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
USP46P62068 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC15.03■□□□□ -0
USP46P62068 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC15.03■□□□□ -0
USP46P62068 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
USP46P62068 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
USP46P62068 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USP46P62068 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USP46P62068 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
USP46P62068 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USP46P62068 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USP46P62068 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USP46P62068 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USP46P62068 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
USP46P62068 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USP46P62068 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USP46P62068 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USP46P62068 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USP46P62068 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
USP46P62068 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USP46P62068 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
USP46P62068 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
USP46P62068 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USP46P62068 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USP46P62068 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.03■□□□□ -0
USP46P62068 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
USP46P62068 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
USP46P62068 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
USP46P62068 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
USP46P62068 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
USP46P62068 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
USP46P62068 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
USP46P62068 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
USP46P62068 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
USP46P62068 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.02■□□□□ -0
USP46P62068 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms