Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC01547P58512 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC01547P58512 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC01547P58512 PLA2G6-202ENST00000335539 3060 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC01547P58512 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC01547P58512 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC01547P58512 SNX25-201ENST00000264694 3264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC01547P58512 EPM2AIP1-201ENST00000322716 8126 ntAPPRIS P1 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC01547P58512 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC01547P58512 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC01547P58512 ELN-234ENST00000621115 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC01547P58512 GRM1-202ENST00000355289 3874 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC01547P58512 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC01547P58512 ZNF331-201ENST00000253144 5042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC01547P58512 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC01547P58512 DPY19L2P2-205ENST00000439473 3994 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC01547P58512 SRGAP3-202ENST00000383836 8656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC01547P58512 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC01547P58512 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC01547P58512 ADAMTSL4-202ENST00000369038 4167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC01547P58512 FAM214B-208ENST00000605244 3016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC01547P58512 ZNF318-201ENST00000361428 8006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC01547P58512 SPCS3-201ENST00000503362 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC01547P58512 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC01547P58512 VSTM2A-201ENST00000302287 3401 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC01547P58512 PLEKHA7-202ENST00000355661 4980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC01547P58512 CDHR5-202ENST00000358353 3635 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC01547P58512 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC01547P58512 ST8SIA1-203ENST00000396037 9714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC01547P58512 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC01547P58512 DGKA-202ENST00000394147 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC01547P58512 MEP1A-201ENST00000230588 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC01547P58512 MCRIP1-212ENST00000576730 2979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC01547P58512 COBLL1-225ENST00000629362 3868 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01547P58512 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01547P58512 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01547P58512 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01547P58512 CAPN5-201ENST00000278559 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01547P58512 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01547P58512 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01547P58512 Z98257.2-202ENST00000641138 1548 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01547P58512 LANCL1-205ENST00000443314 4781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01547P58512 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01547P58512 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01547P58512 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01547P58512 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01547P58512 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01547P58512 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01547P58512 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01547P58512 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01547P58512 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01547P58512 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01547P58512 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01547P58512 SPACA9-202ENST00000356311 2243 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01547P58512 SUPT20HL1-201ENST00000436466 2618 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01547P58512 LRRC41-206ENST00000615587 2842 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01547P58512 AL031714.1-202ENST00000568106 3107 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01547P58512 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01547P58512 NCDN-201ENST00000356090 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01547P58512 ITGAX-201ENST00000268296 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01547P58512 GPHN-203ENST00000478722 4297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01547P58512 DCAF12L1-201ENST00000371126 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01547P58512 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01547P58512 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01547P58512 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01547P58512 LPO-204ENST00000543544 2350 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01547P58512 PITPNM3-202ENST00000421306 6945 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01547P58512 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01547P58512 TBC1D3P2-203ENST00000581291 2088 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01547P58512 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01547P58512 AC010336.1-201ENST00000539278 4739 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01547P58512 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01547P58512 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01547P58512 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01547P58512 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01547P58512 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01547P58512 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01547P58512 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01547P58512 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01547P58512 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01547P58512 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01547P58512 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01547P58512 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01547P58512 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01547P58512 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01547P58512 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01547P58512 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01547P58512 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01547P58512 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01547P58512 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01547P58512 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01547P58512 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01547P58512 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01547P58512 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01547P58512 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01547P58512 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01547P58512 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01547P58512 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01547P58512 GREB1-206ENST00000396123 5296 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LINC01547P58512 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms