Protein–RNA interactions for Protein: P45379

TNNT2, Troponin T, cardiac muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT2P45379 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TNNT2P45379 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TNNT2P45379 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TNNT2P45379 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TNNT2P45379 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TNNT2P45379 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TNNT2P45379 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TNNT2P45379 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TNNT2P45379 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TNNT2P45379 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TNNT2P45379 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TNNT2P45379 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TNNT2P45379 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TNNT2P45379 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TNNT2P45379 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TNNT2P45379 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TNNT2P45379 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TNNT2P45379 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TNNT2P45379 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TNNT2P45379 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TNNT2P45379 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TNNT2P45379 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TNNT2P45379 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TNNT2P45379 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TNNT2P45379 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TNNT2P45379 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TNNT2P45379 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TNNT2P45379 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TNNT2P45379 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TNNT2P45379 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TNNT2P45379 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TNNT2P45379 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TNNT2P45379 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TNNT2P45379 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TNNT2P45379 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TNNT2P45379 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TNNT2P45379 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TNNT2P45379 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TNNT2P45379 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TNNT2P45379 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TNNT2P45379 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TNNT2P45379 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TNNT2P45379 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TNNT2P45379 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TNNT2P45379 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TNNT2P45379 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TNNT2P45379 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TNNT2P45379 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TNNT2P45379 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TNNT2P45379 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TNNT2P45379 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TNNT2P45379 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TNNT2P45379 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TNNT2P45379 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TNNT2P45379 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TNNT2P45379 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TNNT2P45379 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TNNT2P45379 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TNNT2P45379 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TNNT2P45379 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TNNT2P45379 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TNNT2P45379 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TNNT2P45379 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TNNT2P45379 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TNNT2P45379 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TNNT2P45379 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TNNT2P45379 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TNNT2P45379 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TNNT2P45379 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TNNT2P45379 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TNNT2P45379 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TNNT2P45379 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TNNT2P45379 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TNNT2P45379 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TNNT2P45379 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TNNT2P45379 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TNNT2P45379 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TNNT2P45379 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TNNT2P45379 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNNT2P45379 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNNT2P45379 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNNT2P45379 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNNT2P45379 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNNT2P45379 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNNT2P45379 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNNT2P45379 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNNT2P45379 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNNT2P45379 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TNNT2P45379 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNNT2P45379 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNNT2P45379 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNNT2P45379 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNNT2P45379 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNNT2P45379 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TNNT2P45379 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNNT2P45379 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TNNT2P45379 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNNT2P45379 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNNT2P45379 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNNT2P45379 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms