Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGS1P23219 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGS1P23219 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGS1P23219 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGS1P23219 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGS1P23219 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGS1P23219 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGS1P23219 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGS1P23219 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGS1P23219 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGS1P23219 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGS1P23219 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGS1P23219 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGS1P23219 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGS1P23219 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGS1P23219 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGS1P23219 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGS1P23219 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGS1P23219 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGS1P23219 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGS1P23219 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGS1P23219 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGS1P23219 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGS1P23219 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGS1P23219 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGS1P23219 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGS1P23219 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGS1P23219 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGS1P23219 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGS1P23219 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGS1P23219 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGS1P23219 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGS1P23219 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGS1P23219 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGS1P23219 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGS1P23219 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGS1P23219 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTGS1P23219 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PTGS1P23219 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PTGS1P23219 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PTGS1P23219 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PTGS1P23219 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PTGS1P23219 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PTGS1P23219 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGS1P23219 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGS1P23219 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGS1P23219 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGS1P23219 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGS1P23219 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGS1P23219 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGS1P23219 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGS1P23219 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGS1P23219 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGS1P23219 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGS1P23219 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGS1P23219 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGS1P23219 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGS1P23219 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGS1P23219 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGS1P23219 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGS1P23219 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGS1P23219 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGS1P23219 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGS1P23219 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGS1P23219 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGS1P23219 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGS1P23219 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGS1P23219 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGS1P23219 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGS1P23219 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGS1P23219 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGS1P23219 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGS1P23219 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGS1P23219 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGS1P23219 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGS1P23219 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGS1P23219 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGS1P23219 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGS1P23219 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGS1P23219 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGS1P23219 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGS1P23219 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGS1P23219 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGS1P23219 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGS1P23219 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGS1P23219 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGS1P23219 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGS1P23219 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGS1P23219 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTGS1P23219 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTGS1P23219 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTGS1P23219 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTGS1P23219 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTGS1P23219 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTGS1P23219 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTGS1P23219 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTGS1P23219 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTGS1P23219 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTGS1P23219 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTGS1P23219 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms