Protein–RNA interactions for Protein: P09496

CLTA, Clathrin light chain A, humanhuman

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTAP09496 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLTAP09496 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLTAP09496 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLTAP09496 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLTAP09496 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CLTAP09496 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLTAP09496 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLTAP09496 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CLTAP09496 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLTAP09496 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLTAP09496 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLTAP09496 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLTAP09496 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLTAP09496 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CLTAP09496 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLTAP09496 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CLTAP09496 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLTAP09496 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLTAP09496 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLTAP09496 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLTAP09496 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLTAP09496 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLTAP09496 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLTAP09496 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLTAP09496 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CLTAP09496 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLTAP09496 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLTAP09496 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CLTAP09496 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLTAP09496 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLTAP09496 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLTAP09496 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLTAP09496 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLTAP09496 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLTAP09496 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLTAP09496 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLTAP09496 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLTAP09496 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLTAP09496 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLTAP09496 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLTAP09496 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLTAP09496 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLTAP09496 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLTAP09496 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLTAP09496 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLTAP09496 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLTAP09496 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLTAP09496 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLTAP09496 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLTAP09496 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLTAP09496 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLTAP09496 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLTAP09496 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLTAP09496 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLTAP09496 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLTAP09496 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLTAP09496 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLTAP09496 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLTAP09496 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLTAP09496 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLTAP09496 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLTAP09496 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLTAP09496 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLTAP09496 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLTAP09496 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLTAP09496 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLTAP09496 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLTAP09496 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLTAP09496 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLTAP09496 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLTAP09496 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLTAP09496 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLTAP09496 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLTAP09496 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLTAP09496 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLTAP09496 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLTAP09496 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLTAP09496 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLTAP09496 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLTAP09496 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLTAP09496 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLTAP09496 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLTAP09496 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLTAP09496 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLTAP09496 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLTAP09496 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLTAP09496 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLTAP09496 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLTAP09496 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLTAP09496 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLTAP09496 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLTAP09496 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLTAP09496 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLTAP09496 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLTAP09496 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLTAP09496 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLTAP09496 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLTAP09496 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLTAP09496 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLTAP09496 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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