Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
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CLDN9O95484 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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CLDN9O95484 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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CLDN9O95484 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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CLDN9O95484 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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