Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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ARL2-SNX15V9GYD0 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
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ARL2-SNX15V9GYD0 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
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ARL2-SNX15V9GYD0 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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ARL2-SNX15V9GYD0 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
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ARL2-SNX15V9GYD0 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 DMTF1-202ENST00000394703 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 CACNA2D2-202ENST00000360963 5272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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ARL2-SNX15V9GYD0 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
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ARL2-SNX15V9GYD0 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 IL10-202ENST00000423557 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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ARL2-SNX15V9GYD0 AMER1-202ENST00000374869 3688 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 RAB3D-201ENST00000222120 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 SHROOM3-201ENST00000296043 11020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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ARL2-SNX15V9GYD0 HDLBP-204ENST00000391976 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
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ARL2-SNX15V9GYD0 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
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ARL2-SNX15V9GYD0 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 POM121L9P-201ENST00000414583 5018 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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