Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K1

CC2D2A, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D2AQ9P2K1 AC099689.1-201ENST00000624383 1302 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CC2D2AQ9P2K1 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CC2D2AQ9P2K1 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CC2D2AQ9P2K1 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CC2D2AQ9P2K1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CC2D2AQ9P2K1 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CC2D2AQ9P2K1 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CC2D2AQ9P2K1 FAM96A-201ENST00000300030 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CC2D2AQ9P2K1 OR4C6-201ENST00000314259 1020 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CC2D2AQ9P2K1 GSTK1-201ENST00000358406 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CC2D2AQ9P2K1 TRGV4-201ENST00000390345 688 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CC2D2AQ9P2K1 C2orf27AP2-201ENST00000438438 555 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CC2D2AQ9P2K1 CDCA4P3-201ENST00000442572 689 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CC2D2AQ9P2K1 AC010136.1-201ENST00000450996 568 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CC2D2AQ9P2K1 TCP10L-202ENST00000472557 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CC2D2AQ9P2K1 DERL1-204ENST00000519018 575 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CC2D2AQ9P2K1 AC051619.6-201ENST00000558039 595 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CC2D2AQ9P2K1 MARVELD3-205ENST00000567501 582 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CC2D2AQ9P2K1 AC008915.2-201ENST00000570080 730 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CC2D2AQ9P2K1 AL355338.1-201ENST00000612598 913 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CC2D2AQ9P2K1 Metazoa_SRP.68-201ENST00000612673 282 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CC2D2AQ9P2K1 IFI27-214ENST00000620396 599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CC2D2AQ9P2K1 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CC2D2AQ9P2K1 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CC2D2AQ9P2K1 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CC2D2AQ9P2K1 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CC2D2AQ9P2K1 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CC2D2AQ9P2K1 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CC2D2AQ9P2K1 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CC2D2AQ9P2K1 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CC2D2AQ9P2K1 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CC2D2AQ9P2K1 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CC2D2AQ9P2K1 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CC2D2AQ9P2K1 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CC2D2AQ9P2K1 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CC2D2AQ9P2K1 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CC2D2AQ9P2K1 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CC2D2AQ9P2K1 SAA2-206ENST00000530400 323 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CC2D2AQ9P2K1 AL353997.3-201ENST00000586597 589 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CC2D2AQ9P2K1 AC092069.1-201ENST00000589120 270 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CC2D2AQ9P2K1 C17orf98-201ENST00000614158 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CC2D2AQ9P2K1 Metazoa_SRP.97-201ENST00000618280 304 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CC2D2AQ9P2K1 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CC2D2AQ9P2K1 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 PPP4R1L-201ENST00000244070 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 FKBP4P7-201ENST00000433874 1363 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 PLPP4-201ENST00000369073 1135 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 AL450322.2-201ENST00000421629 759 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 TRGV2-201ENST00000426402 544 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 AC023157.1-201ENST00000453713 402 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 AC079944.2-201ENST00000478867 734 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 DDX6-202ENST00000526070 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 GOLGA8N-205ENST00000569659 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 TRNT1-202ENST00000280591 2180 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 AC124319.4-201ENST00000622931 2161 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 RCC2P5-201ENST00000492126 1487 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 NHP2-201ENST00000274606 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 OR6N1-201ENST00000335094 1027 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 TGFA-207ENST00000450929 950 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 AC104117.1-201ENST00000517817 900 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 PIGCP1-201ENST00000527583 895 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 DHRS7-202ENST00000536410 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 MYL6-210ENST00000548400 573 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 AC020909.3-201ENST00000598194 375 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 AC108002.3-201ENST00000612629 503 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 MAP3K14-205ENST00000617331 1049 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 KIR3DL3-201ENST00000291860 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 AL513497.1-201ENST00000624273 2083 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 PRKACB-205ENST00000370688 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 PRAMEF25-201ENST00000614839 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 PRAMEF26-201ENST00000624207 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CC2D2AQ9P2K1 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms