Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUP7

TRMT13, tRNA:m(4)X modification enzyme TRM13 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT13Q9NUP7 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRMT13Q9NUP7 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRMT13Q9NUP7 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRMT13Q9NUP7 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRMT13Q9NUP7 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRMT13Q9NUP7 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms