Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ76

CNTNAP3, Contactin-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP3Q9BZ76 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNTNAP3Q9BZ76 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNTNAP3Q9BZ76 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNTNAP3Q9BZ76 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNTNAP3Q9BZ76 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNTNAP3Q9BZ76 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNTNAP3Q9BZ76 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNTNAP3Q9BZ76 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNTNAP3Q9BZ76 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNTNAP3Q9BZ76 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNTNAP3Q9BZ76 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTNAP3Q9BZ76 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTNAP3Q9BZ76 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTNAP3Q9BZ76 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTNAP3Q9BZ76 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTNAP3Q9BZ76 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTNAP3Q9BZ76 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTNAP3Q9BZ76 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTNAP3Q9BZ76 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTNAP3Q9BZ76 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTNAP3Q9BZ76 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTNAP3Q9BZ76 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTNAP3Q9BZ76 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTNAP3Q9BZ76 RIBC1-202ENST00000375327 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTNAP3Q9BZ76 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTNAP3Q9BZ76 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTNAP3Q9BZ76 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTNAP3Q9BZ76 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTNAP3Q9BZ76 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTNAP3Q9BZ76 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTNAP3Q9BZ76 CNBP-202ENST00000441626 1040 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTNAP3Q9BZ76 KRT19P4-201ENST00000443208 943 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTNAP3Q9BZ76 AC025594.1-201ENST00000469533 543 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTNAP3Q9BZ76 AC008494.1-201ENST00000497612 796 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTNAP3Q9BZ76 POLR3G-207ENST00000514483 682 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTNAP3Q9BZ76 AC113133.1-201ENST00000522388 1088 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTNAP3Q9BZ76 EEF1AKMT3-203ENST00000548256 561 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTNAP3Q9BZ76 ETFRF1-205ENST00000555711 783 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTNAP3Q9BZ76 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTNAP3Q9BZ76 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTNAP3Q9BZ76 IFNL3P1-201ENST00000595082 501 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTNAP3Q9BZ76 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTNAP3Q9BZ76 AC008764.4-207ENST00000600705 956 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTNAP3Q9BZ76 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTNAP3Q9BZ76 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTNAP3Q9BZ76 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTNAP3Q9BZ76 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTNAP3Q9BZ76 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTNAP3Q9BZ76 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTNAP3Q9BZ76 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTNAP3Q9BZ76 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTNAP3Q9BZ76 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTNAP3Q9BZ76 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTNAP3Q9BZ76 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTNAP3Q9BZ76 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTNAP3Q9BZ76 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTNAP3Q9BZ76 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTNAP3Q9BZ76 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTNAP3Q9BZ76 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTNAP3Q9BZ76 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTNAP3Q9BZ76 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTNAP3Q9BZ76 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTNAP3Q9BZ76 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTNAP3Q9BZ76 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTNAP3Q9BZ76 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNTNAP3Q9BZ76 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CNTNAP3Q9BZ76 RPAIN-202ENST00000381208 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CNTNAP3Q9BZ76 LINC00205-201ENST00000433465 1391 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CNTNAP3Q9BZ76 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CNTNAP3Q9BZ76 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CNTNAP3Q9BZ76 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CNTNAP3Q9BZ76 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CNTNAP3Q9BZ76 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CNTNAP3Q9BZ76 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CNTNAP3Q9BZ76 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CNTNAP3Q9BZ76 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 CCL24-201ENST00000222902 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 AC011997.1-201ENST00000409845 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 FDPSP7-201ENST00000429043 1054 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 AC004910.1-201ENST00000433493 787 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 PILRA-205ENST00000453419 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 AP000640.1-201ENST00000525337 879 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 AP003043.1-201ENST00000527804 547 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 AC024405.2-201ENST00000528459 810 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 USP3-AS1-204ENST00000559861 620 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms