Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
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RNF148Q8N7C7 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 TRPC7-202ENST00000378459 2406 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 IFT172-203ENST00000416524 1982 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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RNF148Q8N7C7 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 DNAJC14-202ENST00000317287 2774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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RNF148Q8N7C7 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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RNF148Q8N7C7 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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RNF148Q8N7C7 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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RNF148Q8N7C7 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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RNF148Q8N7C7 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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RNF148Q8N7C7 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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RNF148Q8N7C7 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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RNF148Q8N7C7 TCTN2-202ENST00000426174 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF148Q8N7C7 ZNF180-201ENST00000221327 4335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF148Q8N7C7 PDE9A-202ENST00000328862 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF148Q8N7C7 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF148Q8N7C7 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF148Q8N7C7 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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