Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 CMIP-208ENST00000566462 3512 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 NRXN1-259ENST00000637511 3651 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 SLC35A4-203ENST00000612662 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 TJAP1-205ENST00000372452 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 SLC8A3-205ENST00000394330 2622 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms