Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms