Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms