Protein–RNA interactions for Protein: P59046

NLRP12, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,061 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP12P59046 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NLRP12P59046 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NLRP12P59046 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NLRP12P59046 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NLRP12P59046 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NLRP12P59046 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NLRP12P59046 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NLRP12P59046 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NLRP12P59046 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NLRP12P59046 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NLRP12P59046 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NLRP12P59046 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NLRP12P59046 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NLRP12P59046 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NLRP12P59046 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NLRP12P59046 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NLRP12P59046 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NLRP12P59046 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NLRP12P59046 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NLRP12P59046 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NLRP12P59046 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NLRP12P59046 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NLRP12P59046 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NLRP12P59046 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NLRP12P59046 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NLRP12P59046 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NLRP12P59046 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NLRP12P59046 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NLRP12P59046 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NLRP12P59046 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NLRP12P59046 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NLRP12P59046 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NLRP12P59046 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NLRP12P59046 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NLRP12P59046 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NLRP12P59046 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NLRP12P59046 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NLRP12P59046 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NLRP12P59046 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NLRP12P59046 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NLRP12P59046 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NLRP12P59046 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NLRP12P59046 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NLRP12P59046 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NLRP12P59046 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NLRP12P59046 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NLRP12P59046 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NLRP12P59046 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NLRP12P59046 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NLRP12P59046 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NLRP12P59046 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NLRP12P59046 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NLRP12P59046 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NLRP12P59046 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NLRP12P59046 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NLRP12P59046 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NLRP12P59046 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NLRP12P59046 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NLRP12P59046 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NLRP12P59046 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NLRP12P59046 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NLRP12P59046 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NLRP12P59046 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NLRP12P59046 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NLRP12P59046 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NLRP12P59046 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NLRP12P59046 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NLRP12P59046 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NLRP12P59046 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NLRP12P59046 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NLRP12P59046 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NLRP12P59046 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NLRP12P59046 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NLRP12P59046 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NLRP12P59046 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NLRP12P59046 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NLRP12P59046 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NLRP12P59046 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NLRP12P59046 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NLRP12P59046 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NLRP12P59046 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NLRP12P59046 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NLRP12P59046 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NLRP12P59046 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NLRP12P59046 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NLRP12P59046 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NLRP12P59046 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NLRP12P59046 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NLRP12P59046 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NLRP12P59046 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NLRP12P59046 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NLRP12P59046 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NLRP12P59046 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NLRP12P59046 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NLRP12P59046 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NLRP12P59046 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NLRP12P59046 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NLRP12P59046 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NLRP12P59046 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NLRP12P59046 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms