Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RANGAP1P46060 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RANGAP1P46060 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RANGAP1P46060 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RANGAP1P46060 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RANGAP1P46060 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RANGAP1P46060 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RANGAP1P46060 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RANGAP1P46060 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RANGAP1P46060 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RANGAP1P46060 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RANGAP1P46060 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RANGAP1P46060 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RANGAP1P46060 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RANGAP1P46060 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RANGAP1P46060 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RANGAP1P46060 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RANGAP1P46060 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RANGAP1P46060 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RANGAP1P46060 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RANGAP1P46060 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RANGAP1P46060 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RANGAP1P46060 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RANGAP1P46060 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RANGAP1P46060 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RANGAP1P46060 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RANGAP1P46060 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RANGAP1P46060 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RANGAP1P46060 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RANGAP1P46060 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RANGAP1P46060 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RANGAP1P46060 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RANGAP1P46060 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RANGAP1P46060 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RANGAP1P46060 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RANGAP1P46060 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RANGAP1P46060 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RANGAP1P46060 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RANGAP1P46060 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RANGAP1P46060 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RANGAP1P46060 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RANGAP1P46060 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RANGAP1P46060 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RANGAP1P46060 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RANGAP1P46060 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RANGAP1P46060 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RANGAP1P46060 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RANGAP1P46060 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RANGAP1P46060 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RANGAP1P46060 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RANGAP1P46060 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RANGAP1P46060 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RANGAP1P46060 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RANGAP1P46060 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RANGAP1P46060 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RANGAP1P46060 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RANGAP1P46060 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RANGAP1P46060 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RANGAP1P46060 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RANGAP1P46060 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RANGAP1P46060 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RANGAP1P46060 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RANGAP1P46060 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RANGAP1P46060 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RANGAP1P46060 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RANGAP1P46060 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RANGAP1P46060 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RANGAP1P46060 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RANGAP1P46060 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RANGAP1P46060 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RANGAP1P46060 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RANGAP1P46060 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RANGAP1P46060 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RANGAP1P46060 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RANGAP1P46060 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RANGAP1P46060 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RANGAP1P46060 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RANGAP1P46060 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RANGAP1P46060 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RANGAP1P46060 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RANGAP1P46060 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RANGAP1P46060 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RANGAP1P46060 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RANGAP1P46060 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RANGAP1P46060 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RANGAP1P46060 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RANGAP1P46060 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RANGAP1P46060 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RANGAP1P46060 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RANGAP1P46060 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RANGAP1P46060 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RANGAP1P46060 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RANGAP1P46060 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RANGAP1P46060 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RANGAP1P46060 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RANGAP1P46060 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RANGAP1P46060 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RANGAP1P46060 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RANGAP1P46060 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RANGAP1P46060 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms