Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms