Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCP2P22307 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCP2P22307 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCP2P22307 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCP2P22307 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCP2P22307 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCP2P22307 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCP2P22307 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCP2P22307 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCP2P22307 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCP2P22307 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCP2P22307 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCP2P22307 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCP2P22307 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCP2P22307 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCP2P22307 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCP2P22307 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCP2P22307 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCP2P22307 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCP2P22307 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCP2P22307 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCP2P22307 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCP2P22307 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCP2P22307 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCP2P22307 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCP2P22307 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCP2P22307 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCP2P22307 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCP2P22307 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCP2P22307 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCP2P22307 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCP2P22307 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCP2P22307 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCP2P22307 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SCP2P22307 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCP2P22307 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCP2P22307 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCP2P22307 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SCP2P22307 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCP2P22307 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SCP2P22307 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCP2P22307 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCP2P22307 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCP2P22307 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCP2P22307 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCP2P22307 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCP2P22307 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCP2P22307 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCP2P22307 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCP2P22307 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCP2P22307 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCP2P22307 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCP2P22307 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCP2P22307 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCP2P22307 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SCP2P22307 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SCP2P22307 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SCP2P22307 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SCP2P22307 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SCP2P22307 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SCP2P22307 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCP2P22307 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCP2P22307 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCP2P22307 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCP2P22307 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCP2P22307 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCP2P22307 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCP2P22307 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SCP2P22307 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCP2P22307 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCP2P22307 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCP2P22307 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SCP2P22307 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCP2P22307 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCP2P22307 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCP2P22307 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCP2P22307 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCP2P22307 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCP2P22307 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCP2P22307 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SCP2P22307 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCP2P22307 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SCP2P22307 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SCP2P22307 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCP2P22307 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCP2P22307 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCP2P22307 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCP2P22307 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCP2P22307 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCP2P22307 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCP2P22307 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCP2P22307 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCP2P22307 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCP2P22307 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCP2P22307 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCP2P22307 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCP2P22307 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCP2P22307 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCP2P22307 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCP2P22307 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms