Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms