Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms