Protein–RNA interactions for Protein: P05937

CALB1, Calbindin, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB1P05937 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CALB1P05937 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CALB1P05937 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CALB1P05937 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CALB1P05937 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CALB1P05937 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CALB1P05937 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CALB1P05937 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CALB1P05937 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CALB1P05937 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CALB1P05937 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CALB1P05937 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CALB1P05937 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CALB1P05937 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CALB1P05937 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CALB1P05937 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CALB1P05937 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CALB1P05937 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CALB1P05937 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CALB1P05937 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CALB1P05937 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CALB1P05937 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CALB1P05937 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CALB1P05937 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CALB1P05937 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CALB1P05937 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CALB1P05937 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CALB1P05937 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CALB1P05937 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CALB1P05937 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CALB1P05937 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CALB1P05937 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CALB1P05937 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CALB1P05937 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CALB1P05937 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CALB1P05937 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CALB1P05937 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CALB1P05937 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CALB1P05937 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CALB1P05937 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CALB1P05937 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CALB1P05937 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CALB1P05937 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CALB1P05937 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CALB1P05937 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CALB1P05937 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CALB1P05937 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CALB1P05937 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CALB1P05937 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CALB1P05937 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CALB1P05937 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CALB1P05937 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CALB1P05937 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CALB1P05937 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CALB1P05937 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CALB1P05937 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CALB1P05937 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CALB1P05937 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CALB1P05937 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CALB1P05937 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CALB1P05937 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CALB1P05937 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CALB1P05937 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CALB1P05937 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CALB1P05937 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CALB1P05937 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CALB1P05937 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CALB1P05937 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CALB1P05937 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CALB1P05937 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CALB1P05937 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CALB1P05937 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CALB1P05937 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CALB1P05937 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CALB1P05937 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CALB1P05937 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CALB1P05937 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CALB1P05937 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CALB1P05937 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CALB1P05937 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CALB1P05937 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CALB1P05937 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CALB1P05937 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CALB1P05937 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CALB1P05937 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CALB1P05937 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CALB1P05937 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CALB1P05937 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CALB1P05937 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CALB1P05937 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CALB1P05937 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CALB1P05937 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CALB1P05937 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CALB1P05937 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CALB1P05937 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CALB1P05937 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CALB1P05937 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CALB1P05937 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CALB1P05937 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CALB1P05937 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms