Protein–RNA interactions for Protein: P00338

LDHA, L-lactate dehydrogenase A chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDHAP00338 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDHAP00338 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDHAP00338 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDHAP00338 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDHAP00338 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LDHAP00338 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDHAP00338 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDHAP00338 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDHAP00338 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDHAP00338 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LDHAP00338 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LDHAP00338 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDHAP00338 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDHAP00338 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDHAP00338 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDHAP00338 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDHAP00338 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDHAP00338 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDHAP00338 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDHAP00338 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDHAP00338 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDHAP00338 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDHAP00338 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDHAP00338 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDHAP00338 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDHAP00338 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDHAP00338 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDHAP00338 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDHAP00338 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LDHAP00338 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDHAP00338 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDHAP00338 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDHAP00338 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDHAP00338 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDHAP00338 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDHAP00338 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDHAP00338 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDHAP00338 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDHAP00338 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDHAP00338 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDHAP00338 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDHAP00338 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDHAP00338 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDHAP00338 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDHAP00338 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDHAP00338 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDHAP00338 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDHAP00338 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDHAP00338 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LDHAP00338 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LDHAP00338 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDHAP00338 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDHAP00338 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDHAP00338 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDHAP00338 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDHAP00338 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDHAP00338 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDHAP00338 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDHAP00338 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDHAP00338 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDHAP00338 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDHAP00338 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDHAP00338 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDHAP00338 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDHAP00338 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDHAP00338 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDHAP00338 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDHAP00338 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDHAP00338 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDHAP00338 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDHAP00338 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDHAP00338 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDHAP00338 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDHAP00338 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LDHAP00338 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LDHAP00338 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDHAP00338 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LDHAP00338 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LDHAP00338 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDHAP00338 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDHAP00338 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDHAP00338 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDHAP00338 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDHAP00338 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDHAP00338 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDHAP00338 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDHAP00338 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDHAP00338 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDHAP00338 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDHAP00338 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDHAP00338 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDHAP00338 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDHAP00338 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDHAP00338 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDHAP00338 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDHAP00338 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDHAP00338 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDHAP00338 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LDHAP00338 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LDHAP00338 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms