Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 MINDY1-205ENST00000493834 1546 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 AC041040.1-201ENST00000425197 460 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 AC099548.2-201ENST00000491047 571 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 AC025171.3-201ENST00000509036 472 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 AC113133.1-201ENST00000522388 1088 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 RPL10L-201ENST00000298283 812 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 HLA-DMA-202ENST00000395303 1007 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 AC145422.1-201ENST00000541574 544 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 RN7SL605P-201ENST00000577229 281 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 SNCAIP-206ENST00000414317 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 DHRS7C-201ENST00000330255 1006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 POLR3G-207ENST00000514483 682 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 PRSS55-203ENST00000522210 1005 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 FAM187B2P-201ENST00000577135 713 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 MECP2-213ENST00000622433 1071 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms