Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC10.77□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC10.76□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms