Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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PPARGC1AQ9UBK2 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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PPARGC1AQ9UBK2 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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PPARGC1AQ9UBK2 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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PPARGC1AQ9UBK2 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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PPARGC1AQ9UBK2 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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PPARGC1AQ9UBK2 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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PPARGC1AQ9UBK2 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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