Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 AGPAT3-202ENST00000327505 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 AGPAT3-204ENST00000398061 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 PRKAB1-205ENST00000540121 1673 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 EDARADD-204ENST00000637660 2803 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 ALDH1L1-205ENST00000452905 2758 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 PLA2G15-201ENST00000219345 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 ITGA2B-201ENST00000262407 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 TPO-202ENST00000345913 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 VENTX-201ENST00000325980 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 MVP-202ENST00000395353 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 DOK4-210ENST00000566936 2851 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 ATF6B-209ENST00000375201 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 ATF6B-210ENST00000375203 2620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 TRIM35-201ENST00000305364 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 AMER1-202ENST00000374869 3688 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 MARCH10-201ENST00000311269 3090 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 SPINT1-201ENST00000344051 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 MSH5-204ENST00000375755 3094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 PPARGC1B-202ENST00000360453 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 ZNF197-204ENST00000383745 2935 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms