Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH5

NUP35, Nucleoporin NUP53, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP35Q8NFH5 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
NUP35Q8NFH5 AC004147.4-201ENST00000636421 1844 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
NUP35Q8NFH5 ALDH7A1-234ENST00000637782 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
NUP35Q8NFH5 UQCRB-201ENST00000287022 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 ERBB2-202ENST00000406381 4564 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 GRAMD4-201ENST00000361034 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 TRPM5-203ENST00000533060 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 TVP23A-201ENST00000299866 3360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 CYTH1-203ENST00000585509 3315 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 DPP8-201ENST00000300141 3139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 ZNF197-204ENST00000383745 2935 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 URGCP-201ENST00000336086 5658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 VAMP7-202ENST00000286448 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 SLC28A1-201ENST00000286749 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 GRIA4-210ENST00000527669 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 USP19-206ENST00000417901 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 PRR3-202ENST00000376560 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 ZNF239-205ENST00000535642 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 RFFL-201ENST00000315249 7293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 KCNT1-213ENST00000630792 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 MATN2-211ENST00000521689 3554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 FOXN4-202ENST00000355216 2958 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 ESYT3-202ENST00000389567 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 ZFYVE27-201ENST00000337540 2927 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 DCAF5-209ENST00000557386 2883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 TRPM2-201ENST00000300481 5627 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 ARMCX2-202ENST00000330154 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 DNMT3B-205ENST00000443239 2674 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 BTBD3-204ENST00000405977 5137 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 SAMD4A-201ENST00000251091 6565 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 PPT1-204ENST00000439754 2195 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 ADM2-202ENST00000395738 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 HNRNPH1-216ENST00000510411 2105 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 TUBB8P7-202ENST00000564451 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 SGSM3-201ENST00000248929 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 RNFT2-201ENST00000257575 3882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 LRRC41-206ENST00000615587 2842 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 PIK3CG-205ENST00000496166 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 BCL2L1-203ENST00000376062 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 DCAF12L1-201ENST00000371126 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 LYRM9-202ENST00000379103 1685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 PLEKHA7-202ENST00000355661 4980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 NXPE3-201ENST00000273347 3941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 OXR1-202ENST00000312046 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 TFIP11-201ENST00000405938 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 TNFRSF8-203ENST00000417814 3593 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 ENOX2-204ENST00000394363 4174 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 AMER3-202ENST00000423981 6172 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 NRP2-202ENST00000357118 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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