Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 ELN-234ENST00000621115 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 PGBD1-201ENST00000259883 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 GTF2F1-201ENST00000394456 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 NFATC1-203ENST00000329101 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 CDK2-201ENST00000266970 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 CDH8-201ENST00000299345 3728 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 LINC01679-201ENST00000442815 2798 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 ADAM8-201ENST00000415217 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 MCF2L-213ENST00000421756 3560 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 DCAF5-209ENST00000557386 2883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 DSN1-201ENST00000373734 1915 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 SLC38A7-201ENST00000219320 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 ZNF706-209ENST00000520347 3502 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 ZNF774-201ENST00000354377 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 ANKRD20A1-201ENST00000562196 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 DDX54-201ENST00000306014 4377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 ADM2-202ENST00000395738 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 SH3TC1-201ENST00000245105 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 WNT9A-201ENST00000272164 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 RBM10-201ENST00000329236 3201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 PAAF1-201ENST00000310571 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 AC026271.4-201ENST00000578214 1833 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 CTDP1-202ENST00000299543 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 SKA3-202ENST00000314759 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms