Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPPQ6IPU0 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPPQ6IPU0 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPPQ6IPU0 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPPQ6IPU0 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPPQ6IPU0 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPPQ6IPU0 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPPQ6IPU0 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPPQ6IPU0 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPPQ6IPU0 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPPQ6IPU0 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPPQ6IPU0 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPPQ6IPU0 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPPQ6IPU0 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPPQ6IPU0 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPPQ6IPU0 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPPQ6IPU0 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPPQ6IPU0 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPPQ6IPU0 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPPQ6IPU0 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPPQ6IPU0 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPPQ6IPU0 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPPQ6IPU0 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPPQ6IPU0 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPPQ6IPU0 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPPQ6IPU0 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPPQ6IPU0 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPPQ6IPU0 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPPQ6IPU0 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPPQ6IPU0 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPPQ6IPU0 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPPQ6IPU0 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPPQ6IPU0 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPPQ6IPU0 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPPQ6IPU0 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPPQ6IPU0 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPPQ6IPU0 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPPQ6IPU0 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPPQ6IPU0 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPPQ6IPU0 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPPQ6IPU0 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPPQ6IPU0 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPPQ6IPU0 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPPQ6IPU0 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPPQ6IPU0 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPPQ6IPU0 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPPQ6IPU0 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPPQ6IPU0 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CENPPQ6IPU0 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CENPPQ6IPU0 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CENPPQ6IPU0 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CENPPQ6IPU0 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CENPPQ6IPU0 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CENPPQ6IPU0 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPPQ6IPU0 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPPQ6IPU0 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPPQ6IPU0 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPPQ6IPU0 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPPQ6IPU0 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPPQ6IPU0 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPPQ6IPU0 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPPQ6IPU0 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPPQ6IPU0 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPPQ6IPU0 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPPQ6IPU0 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPPQ6IPU0 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPPQ6IPU0 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPPQ6IPU0 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPPQ6IPU0 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPPQ6IPU0 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPPQ6IPU0 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPPQ6IPU0 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPPQ6IPU0 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPPQ6IPU0 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPPQ6IPU0 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPPQ6IPU0 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPPQ6IPU0 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPPQ6IPU0 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPPQ6IPU0 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPPQ6IPU0 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPPQ6IPU0 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPPQ6IPU0 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPPQ6IPU0 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPPQ6IPU0 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPPQ6IPU0 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPPQ6IPU0 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPPQ6IPU0 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPPQ6IPU0 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPPQ6IPU0 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPPQ6IPU0 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPPQ6IPU0 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPPQ6IPU0 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPPQ6IPU0 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPPQ6IPU0 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPPQ6IPU0 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPPQ6IPU0 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPPQ6IPU0 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPPQ6IPU0 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPPQ6IPU0 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPPQ6IPU0 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms