Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 RNF43-201ENST00000407977 5516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 AC011481.3-201ENST00000623895 5594 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 FN1-201ENST00000323926 8708 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 LANCL1-205ENST00000443314 4781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 AFDN-206ENST00000392112 7459 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
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RTL8BQ17RB0 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
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RTL8BQ17RB0 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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RTL8BQ17RB0 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 AL358334.2-201ENST00000553648 4714 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 RTL10-202ENST00000405640 6785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 TMEM168-201ENST00000312814 7470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
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