Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 MYNN-201ENST00000349841 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 MYO7A-202ENST00000409709 7462 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 TCF23-201ENST00000296096 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 CACNA1G-225ENST00000512389 6837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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IMPG1Q17R60 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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IMPG1Q17R60 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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