Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 LINC01995-201ENST00000489016 621 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 AP001981.1-201ENST00000531132 738 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 SATB1-AS1-212ENST00000596152 610 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 AL049840.6-202ENST00000603373 279 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 FAM49B-230ENST00000639004 837 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 RFC1-217ENST00000639695 867 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 AL132996.1-201ENST00000569865 1431 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 ARV1-202ENST00000366658 1170 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 TFDP2-211ENST00000479040 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 CCDC58-205ENST00000479899 545 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 AL352977.2-201ENST00000557101 547 ntTSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 AC104984.1-201ENST00000581633 697 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 Metazoa_SRP.207-201ENST00000612254 285 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 AL512324.3-201ENST00000619383 882 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 AL390964.1-201ENST00000622486 845 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 AL022393.1-201ENST00000625142 1677 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CAMK2BQ13554 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms