Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTBP2P56545 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTBP2P56545 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTBP2P56545 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTBP2P56545 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTBP2P56545 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTBP2P56545 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTBP2P56545 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTBP2P56545 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTBP2P56545 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTBP2P56545 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTBP2P56545 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTBP2P56545 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTBP2P56545 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTBP2P56545 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTBP2P56545 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTBP2P56545 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTBP2P56545 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CTBP2P56545 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTBP2P56545 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTBP2P56545 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTBP2P56545 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTBP2P56545 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTBP2P56545 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTBP2P56545 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTBP2P56545 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTBP2P56545 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTBP2P56545 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTBP2P56545 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTBP2P56545 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTBP2P56545 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTBP2P56545 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTBP2P56545 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTBP2P56545 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTBP2P56545 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTBP2P56545 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTBP2P56545 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTBP2P56545 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTBP2P56545 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CTBP2P56545 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTBP2P56545 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTBP2P56545 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTBP2P56545 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTBP2P56545 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CTBP2P56545 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTBP2P56545 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTBP2P56545 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTBP2P56545 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTBP2P56545 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTBP2P56545 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTBP2P56545 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTBP2P56545 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTBP2P56545 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTBP2P56545 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTBP2P56545 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTBP2P56545 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTBP2P56545 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTBP2P56545 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTBP2P56545 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTBP2P56545 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTBP2P56545 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTBP2P56545 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTBP2P56545 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTBP2P56545 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTBP2P56545 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTBP2P56545 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTBP2P56545 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTBP2P56545 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTBP2P56545 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTBP2P56545 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTBP2P56545 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTBP2P56545 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTBP2P56545 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTBP2P56545 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTBP2P56545 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTBP2P56545 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTBP2P56545 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTBP2P56545 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTBP2P56545 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CTBP2P56545 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTBP2P56545 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTBP2P56545 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTBP2P56545 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTBP2P56545 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTBP2P56545 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTBP2P56545 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTBP2P56545 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTBP2P56545 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTBP2P56545 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTBP2P56545 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTBP2P56545 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTBP2P56545 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTBP2P56545 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTBP2P56545 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTBP2P56545 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CTBP2P56545 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CTBP2P56545 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTBP2P56545 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTBP2P56545 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTBP2P56545 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms