Protein–RNA interactions for Protein: P28066

PSMA5, Proteasome subunit alpha type-5, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA5P28066 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMA5P28066 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PSMA5P28066 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMA5P28066 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMA5P28066 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMA5P28066 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMA5P28066 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMA5P28066 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMA5P28066 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMA5P28066 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMA5P28066 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMA5P28066 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMA5P28066 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMA5P28066 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMA5P28066 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMA5P28066 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMA5P28066 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMA5P28066 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMA5P28066 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMA5P28066 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMA5P28066 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMA5P28066 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMA5P28066 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMA5P28066 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMA5P28066 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMA5P28066 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMA5P28066 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMA5P28066 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMA5P28066 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMA5P28066 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMA5P28066 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMA5P28066 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMA5P28066 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMA5P28066 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMA5P28066 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMA5P28066 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMA5P28066 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMA5P28066 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMA5P28066 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMA5P28066 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMA5P28066 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMA5P28066 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMA5P28066 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMA5P28066 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMA5P28066 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMA5P28066 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMA5P28066 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMA5P28066 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMA5P28066 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMA5P28066 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMA5P28066 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMA5P28066 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMA5P28066 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMA5P28066 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMA5P28066 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMA5P28066 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMA5P28066 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMA5P28066 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMA5P28066 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMA5P28066 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMA5P28066 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMA5P28066 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMA5P28066 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMA5P28066 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMA5P28066 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMA5P28066 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms