Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYT1P21579 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYT1P21579 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYT1P21579 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT1P21579 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT1P21579 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT1P21579 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT1P21579 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT1P21579 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT1P21579 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT1P21579 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT1P21579 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT1P21579 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT1P21579 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT1P21579 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT1P21579 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT1P21579 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT1P21579 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT1P21579 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT1P21579 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT1P21579 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT1P21579 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT1P21579 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT1P21579 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT1P21579 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT1P21579 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT1P21579 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT1P21579 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT1P21579 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT1P21579 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT1P21579 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT1P21579 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT1P21579 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT1P21579 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT1P21579 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT1P21579 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT1P21579 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT1P21579 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT1P21579 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT1P21579 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT1P21579 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT1P21579 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT1P21579 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT1P21579 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT1P21579 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT1P21579 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT1P21579 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT1P21579 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT1P21579 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT1P21579 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYT1P21579 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT1P21579 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT1P21579 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT1P21579 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT1P21579 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT1P21579 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT1P21579 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT1P21579 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT1P21579 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT1P21579 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT1P21579 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT1P21579 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT1P21579 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT1P21579 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT1P21579 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT1P21579 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT1P21579 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT1P21579 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT1P21579 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT1P21579 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT1P21579 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT1P21579 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT1P21579 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT1P21579 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT1P21579 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT1P21579 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT1P21579 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT1P21579 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT1P21579 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT1P21579 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT1P21579 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT1P21579 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT1P21579 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT1P21579 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT1P21579 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT1P21579 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT1P21579 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT1P21579 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT1P21579 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYT1P21579 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SYT1P21579 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SYT1P21579 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SYT1P21579 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SYT1P21579 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SYT1P21579 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SYT1P21579 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SYT1P21579 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SYT1P21579 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYT1P21579 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYT1P21579 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms