Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GOLGA8SH3BPF8 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GOLGA8SH3BPF8 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GOLGA8SH3BPF8 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GOLGA8SH3BPF8 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GOLGA8SH3BPF8 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GOLGA8SH3BPF8 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GOLGA8SH3BPF8 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GOLGA8SH3BPF8 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GOLGA8SH3BPF8 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GOLGA8SH3BPF8 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GOLGA8SH3BPF8 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GOLGA8SH3BPF8 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GOLGA8SH3BPF8 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GOLGA8SH3BPF8 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GOLGA8SH3BPF8 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GOLGA8SH3BPF8 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GOLGA8SH3BPF8 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GOLGA8SH3BPF8 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GOLGA8SH3BPF8 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GOLGA8SH3BPF8 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GOLGA8SH3BPF8 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GOLGA8SH3BPF8 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GOLGA8SH3BPF8 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GOLGA8SH3BPF8 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GOLGA8SH3BPF8 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GOLGA8SH3BPF8 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GOLGA8SH3BPF8 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GOLGA8SH3BPF8 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GOLGA8SH3BPF8 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GOLGA8SH3BPF8 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GOLGA8SH3BPF8 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GOLGA8SH3BPF8 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GOLGA8SH3BPF8 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GOLGA8SH3BPF8 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GOLGA8SH3BPF8 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GOLGA8SH3BPF8 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GOLGA8SH3BPF8 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GOLGA8SH3BPF8 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GOLGA8SH3BPF8 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GOLGA8SH3BPF8 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GOLGA8SH3BPF8 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GOLGA8SH3BPF8 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GOLGA8SH3BPF8 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GOLGA8SH3BPF8 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GOLGA8SH3BPF8 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GOLGA8SH3BPF8 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GOLGA8SH3BPF8 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GOLGA8SH3BPF8 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GOLGA8SH3BPF8 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GOLGA8SH3BPF8 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GOLGA8SH3BPF8 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GOLGA8SH3BPF8 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GOLGA8SH3BPF8 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GOLGA8SH3BPF8 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GOLGA8SH3BPF8 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GOLGA8SH3BPF8 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GOLGA8SH3BPF8 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GOLGA8SH3BPF8 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GOLGA8SH3BPF8 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GOLGA8SH3BPF8 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GOLGA8SH3BPF8 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GOLGA8SH3BPF8 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GOLGA8SH3BPF8 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GOLGA8SH3BPF8 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GOLGA8SH3BPF8 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GOLGA8SH3BPF8 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GOLGA8SH3BPF8 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GOLGA8SH3BPF8 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GOLGA8SH3BPF8 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GOLGA8SH3BPF8 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GOLGA8SH3BPF8 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GOLGA8SH3BPF8 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GOLGA8SH3BPF8 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GOLGA8SH3BPF8 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GOLGA8SH3BPF8 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GOLGA8SH3BPF8 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GOLGA8SH3BPF8 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GOLGA8SH3BPF8 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GOLGA8SH3BPF8 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GOLGA8SH3BPF8 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GOLGA8SH3BPF8 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GOLGA8SH3BPF8 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GOLGA8SH3BPF8 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GOLGA8SH3BPF8 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GOLGA8SH3BPF8 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GOLGA8SH3BPF8 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GOLGA8SH3BPF8 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GOLGA8SH3BPF8 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GOLGA8SH3BPF8 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GOLGA8SH3BPF8 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GOLGA8SH3BPF8 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GOLGA8SH3BPF8 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GOLGA8SH3BPF8 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GOLGA8SH3BPF8 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GOLGA8SH3BPF8 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GOLGA8SH3BPF8 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GOLGA8SH3BPF8 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GOLGA8SH3BPF8 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GOLGA8SH3BPF8 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms