Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01544-201ENST00000567801 5168 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 FBLN2-207ENST00000492059 4193 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 RAPGEF6-207ENST00000507093 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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ARL2-SNX15V9GYD0 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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ARL2-SNX15V9GYD0 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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ARL2-SNX15V9GYD0 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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ARL2-SNX15V9GYD0 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF629-201ENST00000262525 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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ARL2-SNX15V9GYD0 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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ARL2-SNX15V9GYD0 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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ARL2-SNX15V9GYD0 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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ARL2-SNX15V9GYD0 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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ARL2-SNX15V9GYD0 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
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ARL2-SNX15V9GYD0 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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