Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 RB1-201ENST00000267163 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 FAM193A-201ENST00000324666 4846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 CACNA1G-225ENST00000512389 6837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms