Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR0

KLHL11, Kelch-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL11Q9NVR0 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.3 ms