Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 AL358334.2-201ENST00000553648 4714 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 SH3PXD2A-203ENST00000369774 11468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 DLGAP1-201ENST00000315677 6683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 CACNA1G-225ENST00000512389 6837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 AC073957.3-201ENST00000609998 6758 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 PRMT7-201ENST00000339507 4238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 ARAP3-203ENST00000508305 4927 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms