Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ2

KRTAP9-4, Keratin-associated protein 9-4, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-4Q9BYQ2 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 STN1-202ENST00000369764 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 PSMA1-201ENST00000396394 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 CYP39A1-205ENST00000619708 2269 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 C3orf35-205ENST00000426078 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 APTX-215ENST00000468275 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 ATP5J2-201ENST00000292475 607 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 SPATS1-202ENST00000323108 1107 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC00272-201ENST00000367563 740 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 APOM-202ENST00000375918 922 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 C2orf88-202ENST00000396974 998 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 RBMXP1-201ENST00000408004 1191 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR6B1-201ENST00000408922 1055 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL355339.1-202ENST00000417542 458 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC02246-202ENST00000418954 717 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL671986.1-201ENST00000422197 955 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 RPL36AP35-201ENST00000426082 308 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC01422-202ENST00000438113 517 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 NREP-207ENST00000450761 636 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL133415.1-201ENST00000456355 706 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC104411.1-201ENST00000480817 320 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC022447.5-201ENST00000504817 392 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 TAS2R50-201ENST00000506868 1000 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 CRYAB-211ENST00000531198 1013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 MS4A6A-217ENST00000533023 780 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP001257.1-201ENST00000533106 385 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 NDUFC2-205ENST00000534029 422 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC087798.1-201ENST00000547882 534 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC012038.2-201ENST00000553006 256 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 IFI27L1-209ENST00000555523 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 RORA-AS2-202ENST00000561413 576 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC087481.1-201ENST00000561684 965 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
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