Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 DLG2-205ENST00000398301 2070 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 UBE2A-206ENST00000625938 1381 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 GH1-203ENST00000351388 685 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 NQO2-204ENST00000380454 851 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 AL137244.1-201ENST00000422931 865 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 AC005077.3-201ENST00000449614 213 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 SRP14-208ENST00000560773 468 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 AC008747.1-201ENST00000592220 442 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 AC007193.3-201ENST00000598616 188 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 AC008906.2-201ENST00000606656 474 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 MCM8-AS1-201ENST00000613522 983 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 AC048382.6-201ENST00000621980 1223 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 AL590094.1-208ENST00000636917 627 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 HNRNPC-205ENST00000553300 1375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 VPS28-201ENST00000292510 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 VPS28-202ENST00000377348 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 PRAME-206ENST00000406503 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 RPL15-205ENST00000415719 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 AC027612.2-202ENST00000445955 1199 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 AC112250.1-201ENST00000504640 745 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 RNA5SP420-201ENST00000516997 137 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 AC137579.2-201ENST00000517714 551 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 VPS28-210ENST00000529182 1010 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 AP003168.2-201ENST00000531215 471 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 ANKRD26P1-203ENST00000569528 966 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 AL513497.1-201ENST00000624273 2083 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 SAP18-201ENST00000382533 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SIRT1Q96EB6 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 TCL1A-201ENST00000402399 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 KRT8P42-201ENST00000405771 1399 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 LINC01002-209ENST00000631858 1761 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 MPV17-209ENST00000405983 859 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 RPL18AP16-201ENST00000424057 531 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 TRAPPC4-202ENST00000434101 794 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 HNRNPA3P12-201ENST00000437410 1063 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 AL512288.1-201ENST00000448015 491 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 PHBP18-201ENST00000546648 813 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.6 ms