Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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