Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 AL662797.1-201ENST00000442852 799 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 RNASEH2CP1-201ENST00000454281 502 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 AC019118.1-201ENST00000454530 435 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 AL390961.2-201ENST00000454991 472 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 AC004969.1-201ENST00000471553 578 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 GLT8D2-204ENST00000547583 862 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 AC012087.1-201ENST00000608068 809 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 KCNQ1OT1_1.1-201ENST00000622358 464 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 Metazoa_SRP.210-201ENST00000637921 244 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 WNT8A-202ENST00000398754 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 ARCN1-204ENST00000534182 1669 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 MYC-206ENST00000613283 1365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 EDDM3B-201ENST00000326783 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 CRYZL1-205ENST00000399442 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 SRP9P1-201ENST00000445874 261 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 TRAPPC4-212ENST00000533058 1209 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 EEF1AKMT3-203ENST00000548256 561 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 ADSSL1-208ENST00000555674 520 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 DERL2-206ENST00000572834 589 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 TARM1-202ENST00000616041 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 LINC01002-209ENST00000631858 1761 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 SMUG1-220ENST00000513838 2119 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 AL031056.1-202ENST00000635954 2193 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 TAMM41-201ENST00000273037 1297 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 MUC1-207ENST00000368392 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 MUC1-208ENST00000368393 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 THAP4-203ENST00000402545 833 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 AKT3-IT1-201ENST00000417120 517 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 RBMX2P5-201ENST00000424312 969 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 MUC1-213ENST00000462215 1189 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 AL161668.2-201ENST00000531638 492 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 AC007223.1-201ENST00000564076 572 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 AC095350.1-204ENST00000585405 616 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 Metazoa_SRP.122-201ENST00000610476 285 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 ANAPC15-203ENST00000502597 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 LYRM1-202ENST00000396052 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 MCRS1-203ENST00000546244 1686 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 CTSD-208ENST00000636843 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 FAM133B-204ENST00000445716 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 AC007431.1-201ENST00000578662 1412 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 ZNF485-202ENST00000374435 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 RPSAP16-201ENST00000447583 821 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 AL161727.1-201ENST00000457409 530 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 ARHGEF26-AS1-203ENST00000480639 582 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 NMNAT3-212ENST00000511444 873 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 AC103724.2-201ENST00000520355 476 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 MT1X-202ENST00000562939 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 AC026461.1-201ENST00000567563 551 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 SMIM28-201ENST00000573100 855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 Metazoa_SRP.147-201ENST00000576563 312 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 RN7SL162P-201ENST00000579233 292 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 BOLA3P2-201ENST00000586496 323 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 URGCP-MRPS24-201ENST00000603700 795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 ZSCAN21-203ENST00000456748 1904 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
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