Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBX1P83916 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBX1P83916 MRVI1-201ENST00000423302 6126 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBX1P83916 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBX1P83916 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CBX1P83916 ATIC-201ENST00000236959 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBX1P83916 AC099786.2-201ENST00000427892 2203 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBX1P83916 DAPK1-201ENST00000358077 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBX1P83916 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBX1P83916 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBX1P83916 HTR4-203ENST00000377888 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBX1P83916 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBX1P83916 AGPAT1-204ENST00000395496 2103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBX1P83916 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBX1P83916 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBX1P83916 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CBX1P83916 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBX1P83916 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CBX1P83916 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CBX1P83916 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBX1P83916 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBX1P83916 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBX1P83916 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBX1P83916 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBX1P83916 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBX1P83916 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBX1P83916 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBX1P83916 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBX1P83916 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBX1P83916 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CBX1P83916 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBX1P83916 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBX1P83916 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBX1P83916 SLC13A2-202ENST00000444914 2855 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBX1P83916 THUMPD3-206ENST00000452837 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBX1P83916 DGKZP1-201ENST00000378718 2776 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CBX1P83916 AQP2-201ENST00000199280 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBX1P83916 AMACR-201ENST00000335606 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBX1P83916 PDXDC2P-NPIPB14P-205ENST00000531894 4184 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBX1P83916 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBX1P83916 HERC6-203ENST00000380265 3781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBX1P83916 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBX1P83916 ZNF674-201ENST00000414387 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBX1P83916 MED29-207ENST00000615911 3565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBX1P83916 ANKZF1-202ENST00000409849 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBX1P83916 FAM131B-202ENST00000409346 4295 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBX1P83916 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBX1P83916 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBX1P83916 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CBX1P83916 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CBX1P83916 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CBX1P83916 TNIP1-201ENST00000315050 2785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CBX1P83916 SEC24B-202ENST00000399100 3780 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CBX1P83916 AJAP1-202ENST00000378191 11666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CBX1P83916 C1R-209ENST00000542285 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CBX1P83916 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CBX1P83916 IRAK2-201ENST00000256458 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CBX1P83916 ANKZF1-203ENST00000410034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CBX1P83916 MYL9-201ENST00000279022 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CBX1P83916 ZNF630-206ENST00000442455 2829 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CBX1P83916 GK-205ENST00000378946 3638 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CBX1P83916 LSINCT5-201ENST00000626215 2647 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CBX1P83916 AFF2-202ENST00000342251 7313 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CBX1P83916 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CBX1P83916 AC016582.3-202ENST00000443870 6580 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CBX1P83916 TMCO4-202ENST00000375127 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CBX1P83916 YIPF6-201ENST00000374622 6134 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CBX1P83916 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CBX1P83916 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CBX1P83916 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CBX1P83916 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CBX1P83916 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CBX1P83916 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CBX1P83916 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CBX1P83916 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CBX1P83916 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CBX1P83916 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CBX1P83916 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CBX1P83916 BSDC1-201ENST00000341071 4599 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CBX1P83916 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CBX1P83916 PHLPP2-204ENST00000567016 4812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CBX1P83916 METTL13-201ENST00000361735 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CBX1P83916 CNGA3-203ENST00000393504 3841 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CBX1P83916 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CBX1P83916 HDAC7-202ENST00000354334 4065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CBX1P83916 HDAC7-201ENST00000080059 4095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CBX1P83916 C9orf3-203ENST00000375315 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CBX1P83916 AC106865.1-201ENST00000602666 3034 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CBX1P83916 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CBX1P83916 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CBX1P83916 ZNF773-205ENST00000599847 5832 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CBX1P83916 XAB2-201ENST00000358368 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX1P83916 AL031714.1-201ENST00000567829 2926 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX1P83916 MTRF1L-203ENST00000367233 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX1P83916 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX1P83916 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX1P83916 SMTN-222ENST00000612341 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX1P83916 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX1P83916 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX1P83916 PLEKHG5-203ENST00000377728 3613 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms