Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GGCXP38435 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GGCXP38435 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GGCXP38435 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GGCXP38435 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GGCXP38435 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GGCXP38435 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GGCXP38435 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GGCXP38435 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GGCXP38435 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GGCXP38435 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GGCXP38435 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GGCXP38435 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GGCXP38435 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GGCXP38435 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GGCXP38435 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GGCXP38435 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GGCXP38435 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GGCXP38435 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GGCXP38435 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GGCXP38435 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GGCXP38435 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GGCXP38435 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GGCXP38435 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GGCXP38435 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GGCXP38435 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GGCXP38435 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GGCXP38435 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GGCXP38435 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GGCXP38435 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GGCXP38435 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GGCXP38435 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GGCXP38435 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GGCXP38435 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GGCXP38435 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GGCXP38435 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GGCXP38435 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GGCXP38435 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GGCXP38435 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GGCXP38435 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GGCXP38435 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GGCXP38435 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GGCXP38435 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GGCXP38435 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GGCXP38435 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GGCXP38435 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GGCXP38435 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GGCXP38435 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GGCXP38435 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GGCXP38435 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GGCXP38435 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GGCXP38435 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GGCXP38435 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GGCXP38435 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GGCXP38435 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GGCXP38435 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GGCXP38435 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GGCXP38435 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GGCXP38435 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GGCXP38435 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GGCXP38435 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GGCXP38435 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GGCXP38435 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GGCXP38435 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GGCXP38435 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GGCXP38435 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GGCXP38435 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GGCXP38435 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GGCXP38435 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GGCXP38435 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GGCXP38435 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GGCXP38435 GOSR1-204ENST00000451249 1231 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GGCXP38435 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GGCXP38435 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GGCXP38435 AC097110.1-201ENST00000507344 768 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GGCXP38435 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GGCXP38435 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GGCXP38435 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GGCXP38435 MALAT1-217ENST00000620902 352 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GGCXP38435 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GGCXP38435 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GGCXP38435 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GGCXP38435 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GGCXP38435 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GGCXP38435 SULT1A1-211ENST00000569554 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GGCXP38435 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GGCXP38435 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GGCXP38435 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GGCXP38435 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GGCXP38435 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GGCXP38435 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GGCXP38435 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GGCXP38435 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GGCXP38435 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GGCXP38435 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GGCXP38435 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GGCXP38435 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GGCXP38435 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GGCXP38435 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GGCXP38435 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms